处方
“医药分开”需迫切解决
在《征求意见稿》中，记者看到，要改变“以药养医”的机制，首要解决的就是国家应积极推进“医药分开”，并将“医药分开”列为“改革中需要迫切解决的问题”。
从2002年起，湖南省株洲市就开始探索医药分业管理体制，先后有13家医院将门诊药房改为药店，参与市场竞争。这种尝试采取两种模式：一种模式是与医药公司合作联办药店，所有权归医院，医药公司拥有经营权，共同管理；另一种模式是医疗机构独立经营药店，自负盈亏。
北大光华管理学院卫生经济与管理学系助理教授张炜对“医药分开”的建议非常赞同，他认为，“医药分开”的同时，医生体现高技术含量的医疗服务，如：外科手术等，需要提高收费，以保障“医药分开”后医生的收入。
“但医疗收费增长的负担不能由百姓承担。”张炜肯定地表示，要通过扩大医保来实现。
同时，对“医药分开”的方式，张炜比较主张住院部分的开药仍由医院管理，但门诊和普通病人的日常用药则通过医生开具的处方去外面的药房拿药。
张炜强调，必须坚持医生负责自己的诊疗行为，并且根据医疗的情况开确定处方，而不是像现在的试点都是药房来决定医生开什么药。
制定医药政策不能各自为政
作为改变“以药养医”机制的第二大解决途径，第二次上书给国务院的征求意见稿中就提到，国家在指定医药产业政策时，要加强部门之间的沟通协调，不能各自为政。
“以药养医”的问题由来已久，其影响已经渗透到医药产业的各个环节和层面，从药品的科研、生产、流通、使用都受到影响，企业认为，想要彻底改革绝非易事。所以，各个企业建议，国家有关部门需要统一思想，加强协调，把改革“以药养医”机制作为一项最重要的工作，协同推进，不能各自为政。
张炜表示，在医疗领域，制定任何一个医药政策，都需要各个部门之间的协调、配合，以及多方位的联动。业内人士就认为，中国医药产业的改革还有很多问题，很重要一个原因在于改革措施不到位，存在政出多门现象。虽然成立了国家食品药品监管局，但涉及医药产业管理职能的部门依然较多，药品的定价、招标采购、安全监管、医药产业发展政策等职能分散于各个部门。而各部门往往站在部门和局部利益角度考虑问题，易导致医药产业政策缺乏整体性和系统性。
华北制药集团有限责任公司董事长常幸也曾公开表示，“应该从国家卫生保健大局角度来看医药产业，建立高层次的协调管理体制或机制”。
规范医疗处方
“降低单位药价很难达到降低医疗费用的作用。”张炜很坦白地对记者表示，他认为，只有规范医疗行为，才能谈到降低医疗费用的问题。
我国药品降价已经进行了10年，全国性大规模降价23次，声势很大，但实效却不大。“以药养医”的问题依然存在，群众看病依然感觉“贵”。
张炜分析认为，国家降药价降的是单位药价，但患者是否买所降的那些药，买多少药，则都是由医院和医生来决定，这本身就是一个矛盾。另外，现在一个很普遍的现象是，只要发改委一降价，就会有一大批降价药品从市场上消失，取而代之的是改变单位、剂型的新包装药品出现在市面上。“从自我利益考虑，医生不愿意开那些廉价药。”也就是说，作为药店和医院尽管有其公益性质，但它毕竟是一个经济实体，要靠获取经营利润维系自身的生存。
“解决出路在于要规范医疗行为。”张炜说，如常见病，医生应该开什么药、开多少药，都要进行详细、具体的规范，同时，我国还应该建立规范的处方，以及药品指南、诊疗指南等，并且进行医疗监管。“只有当这个阶段实现后，我们再去研究如何在此基础上降低药价。”
并发症
医药股业绩不容乐观
2006年上市医药企业的业绩不容乐观。去年，国内大部分药品生产企业利润均有不同程度下滑，如白云山预计2006年利润将同比下降50%-100%，2005年白云山净利润为4383万元。同仁堂2006年净利润比2005年的3.01亿元下降48.21%，双鹤药业每股收益0.3748元，同比下降11.65%。
从医药股整体年报业绩来看，普遍表现不如其他行业。中信建投的分析师孙鹏表示，这主要与医药价格明显下降有关。2006年以来，发改委多次调低药品价格，同时由于原材料涨价、企业竞争加剧等因素，使很多医药企业的利润出现不同程度的下降。
张炜表示，由于我国很多企业的大部分产品多为仿制药，而非原研药，目前医药行业中，药品企业很少投入自主创新药的研发，对仿制药的重复投入，使医药产业的整体利润被一再压低。所以发改委多次降药价后，企业就会受到很大冲击。
孙鹏认为，在更加严酷的市场竞争中，医药行业的利润水平下降有其自身必然性。